Меню

Русский выбор страны
Блоггеру будет приятно знать, кто читает его записи
На этот адрес эл. почты Вы будете получать сообщения о новых записях в блоге

Геномика: прошлое, настоящее и будущее свиноводства

Ник Боддикер, доктор наук

Геномика часто становится предметом дискуссий, когда производители свиней заводят речь о генетике. И это понятно, поскольку именно геномика обещает значительные улучшения в свиноводстве. Производители хотят быть уверенны, что компании, занимающиеся разведением свиней и работающие над улучшением породы, используют самые передовые технологии в целях максимизации прибыли их клиентов. Большинство (если не все) крупных генетических компаний в своих разработках используют геномику тем или иным способом. В их числе и Genesus. Многие из публикуемых нами технических докладов посвящены теме геномики или проектам, где геномика является одним из компонентов. Так насколько же исследования этой области генетики способны повлиять на свиней? Не слишком ли разута эта тема? Какую выгоду может извлечь из геномики отрасль свиноводства? 
 
Геном свиньи (общая генетическая составляющая свиньи) был официально представлен в 2009 и опубликован в 2012 году (Groenen et al., 2012). Геном свиньи состоит из 19 пар хромосом, одна из которых является хромосомной парой пола и в длину примерно составляет 2.7 миллиардов пар оснований (нуклеотидов), что походит на протяженность пар оснований генома человека – 3 миллиарда (Bates, 2010). На рисунке справа изображены пары оснований в хромосоме. Большинство из этих пар оснований неинформативны, поскольку у всех свиней они абсолютно одинаковы, но, к счастью, не все. Отличающиеся пары оснований нуклеотидов свиней называются SNPs, или точечные нуклеотидные полиморфизмы. Первый коммерчески доступный чип SNP состоял из ~60,000 SNPs. В течение последних шести или семи лет эти 60,000 SNP используются для идентификации локусов количественных признаков (QTL), которые представляют собой области в геноме, связанные с изменением фенотипа, но не обязательно вызывающие его изменчивость. Эти QTL обычно находятся в непосредственной близости от гена, который вызывает фенотипическую изменчивость.
 
До выхода данных о геноме свиней и чипа SNP для коммерческого доступа, в среднем в год публиковалось до 370 QTL (локусов количественных признаков). Затем, после предоставления информации о геноме, в среднем в год публикуется до 1,350 QTL, то есть, в 3.6 раза в год больше, чем до выделения генома (animalgenome.org). Эти результаты привели к значительному прорыву в тех областях знаний о генах или QTL, которые являются важными не только с научной, но и экономической точки зрения. Ниже приводится график, где, начиная с 2000 года, отражено количество описываемых в год QTL.

Информация о геноме больше всего влияет на выбор тех признаков и черт, которые нельзя получить от животных – кандидатов для селекции (сложно измерить качество туши и мяса без ущерба для здоровья и, также, такие низко наследуемые черты, как например репродуктивный потенциал). Ниже приводится краткая сводка общего числа QTL по классификации черт, о которых было известно к концу 2014 года. Примерно 72% из зарегистрированных QTL  относятся к признакам классификации качества туш, мяса и здоровья. Это не означает, что все эти QLT уже используются в рамках свиноводческой отрасли, но со всей определенностью можно говорить о том, что проводится очень много исследований по идентификации QTL, ассоциируемых с признаками, по которым сложно провести селекцию животных на племенных фермах нуклеус. Это некая точка отсчета для каждой компании, поскольку только от компании зависит, будет ли проводиться проверка наличия этих QTL в их стадах перед их использованием для геномной селекции.

 (Классификация черт: качество туш и мяса, здоровье, производительность, репродукция, экстерьер.)

Исследования показывают, что геномика может увеличить уровень генетического прогресса от 10 до 43% для различных черт (Dekkers, 2007). Тем не менее, в целом включение геномной информации в работу всей отрасли свиноводства идет медленнее, чем, например, в молочной промышленности. Одна из основных причин этого кроется в том, что при производстве коммерческих животных используется перекрестное скрещивание, а свиньи на племенных фермах нуклеус обычно являются чистокровными. Таким образом, существует разрыв между производительностью чистопородных и гибридных животных. Геномика может преодолеть эту разобщенность, если компания по разведению животных имеет доступ к геномной и фенотипической информации гибридных животных.
 
Выше приводится краткое описание того, на каком этапе развития   находится геномика на сегодняшний день и какое место занимает геномика в отрасли свиноводства в текущий момент. Но в каком направлении в отношении геномики будет двигаться отрасль в будущем? Первой ключевой областью является увеличение количества SNP - точечных нуклеотидных полиморфизмов в чипе SNP. Меньшие панели плотности, например, чип 60,000 SNP, не захватывают всю генетическую изменчивость, присутствующую внутри популяции, следовательно, может быть упущена или не полностью отражена важная информация внутри генома. Немногим более года назад была выпущена новая панель, содержащая примерно 80,000 SNP.
Ведутся разработки с применением этой панели и уже на первых этапах исследования, проводимого Genesus, намечаются многообещающие результаты, вероятно, лучше, чем при применении первоначального чипа 60,000 SNP. Новейшей панелью является разработка чипа из 600,000 SNP. Компания Genesus является одной из первых, если не первой свиноводческой генетической компанией, которая использует этот новый чип.
С определенной уверенностью можно говорить о том, что результаты исследований будут доступны уже в ближайшие месяцы. Наибольшее количество SNP расшифровывает, или секвенирует генетическую последовательность, это все 2.7 миллиардов пар оснований нуклеотидов, в настоящее время в Genesus уже секвенировали некоторых животных в пределах их популяции.
Трудно оценить, охватить и проанализировать все огромное количество полученных данных по расшифровке генетической последовательности, могу только заметить, что для работы с этим массивом информации требуется действительно очень мощный компьютер.

 
Другими развивающимися областями исследований, чья важность возросла с момента предоставления информации о геноме свиньи стали нутригеномика (пищевая геномика), эпигенетика (динамика развития) и “пресонифицированные” лекарственные средства для свиней. Так что к геномике обращаются не только генетики, свои исследования также проводят и специалисты по питанию и разработке рационов кормления. Они хотят понять, какой эффект оказывает питание на экспрессию гена, которая затем приводит к различиям в производительности. “Изменяет ли экспрессию гена в положительную, благоприятную сторону применение определенных питательных составляющих в корме?” – нутригенетика ищет ответ на этот вопрос.
 
Уже сейчас со всей очевидностью можно говорить о значительном вкладе геномики в развитие отрасли свиноводства в целом, но при этом необходимо понимать – мы только слегка затронули самую “вершину айсберга”. Информация о геноме свиньи позволила приоткрыть двери для многих областей исследований, которые раньше были просто невозможны.

От Гостя
Вход
OpenID
Вы должны войти на сайт чтобы написать комментарий
Логин или E-mail:
Пароль:
Забыли пароль?
Вы должны войти на сайт чтобы написать комментарий

Почитайте другие наши интересные записи
Эстрофантин - применение препарата     • Обладает лютеолитическими свойствами, т.е. вызывает морфологическую регрессию желтого тела. • Снижает уровень прогестерона, что способствует выделению гонадотропных гормонов (ФСГ и ЛГ), развитию фолликулогенеза в яичниках у самок животных и вызывает полноц
Просмотров: 1332
19.01.2016
Существенные недостатки типовых ферм крупного рогатого скота Большая часть типовых ферм КРС коллективных хозяйств в России была построена по проектам центральных,республиканских и зональных проектных институтов. Опыт проектирования, строительства и эксплуатации ферм выявил целый ряд серьезных недостатков принятых в этих проектах технологических, технических и объемно-планировочных решений. В значительной ст
Просмотров: 2243
21.04.2013
Откорм крупного рогатого скота под открытым небом Три животновода-механизатора откармливают восемьсот голов крупного рогатого скота. Среднесуточные привесы каждого животного — до 1 080 граммов. Мясной цех построен за два месяца. Практика показывает, что ускорить производство мяса, в частности говядины, можно и без больших капитальных вложений, применив для откорма молодняка крупного рогат
Просмотров: 7089
21.04.2013
Фотогалереи
Популярные блоги
Сейчас читают
Влияние микроэлементов и макроэлементов на кукурузу. Одной из ведущих
Выбор желательно остановить на открытом, просторном, солнечном уголке.
На сегодняшний день одной из лучших разновидностей удобрений являются
Гинкго двулопастный (Ginko biloba) – единственный вид в роду и с
Компания «Доза-Агро» является экспертом в области комбикор
Густооблиственный кустарник высотой до 1 м. Цветки крупные, диаметром
Готовить чай из сушеных яблок (3—4 ст. ложки измельченных сушеных ябло
Происхождение немецкой овчарки. Существуют различные теории происхожде
У орхидей все устроено необычно – листья, побеги, корни, цветки.
В ягодах содержится витамин С, Р, Р-активные соединения, кумарины, пек
Международный химический гигант EuroChem Group AG (ОАО «МХК &laq
Антракноз – не очень распространенное, но вредоносное заболевани
Бани серии WB могут использоваться для выпаривания образцов, инкубации
В природе ландыши растут в лесах, кустарниковых зарослях и на горных с
Кизил обыкновенный, или на ботаническом языке - настоящий (Comus mas L